O clube foi fundado como Duque de Caxias Atlético Clube, no município de Caxias em 14 de junho de 1979. Participou do Campeonato Maranhense em 3 edições durante as década de 1990 e depois paralisou suas atividades. Em 2005 retomou suas atividade com um novo nome: Sociedade Esportiva Juventude. Em 2019 o clube saiu do município de Caxias e transferiu sua sede para São Mateus do Maranhão.

O Lago Verde Esporte Clube era um clube amador do município de Lago Verde, mas que em 2025 passou a utilizar o CNPJ e a licença do tradicional Esporte Clube Boa Vontade, que tinha sede em São Luís. O Boa Vontade foi fundado em 01 de junho de 1957 e já participou por dezenas de vezes do Campeonato Maranhense da 1ª Divisão.

O Luminense Atlético Clube foi fundado em 2021 no município de Paço do Lumiar. Em 2025, para se profissionalizar, o clube passou a utilizar o CNPJ e a licença do Santa Quitéria Futebol Clube, tradicional clube de Santa Quitéria do Maranhão que foi fundado em 16 de abril de 2003, e que já participou diversas vezes do Campeonato Maranhense da 1ª Divisão além de possuir 2 títulos da 2ª divisão estadual.

O Tuntum Esporte Clube foi fundado em 01 de junho de 2021 no município de Tuntum. Para que fosse possível disputar competições profissionais, o clube passou a utilizar o CNPJ e a licença do Clube Atlético Babaçu, clube que foi fundado em 02 de setembro de 1996 em São Luís. O Babaçu nunca chegou a disputar uma edição do Campeonato Maranhense da 1ª divisão, tendo apenas algumas poucas participações no estadual da 2ª divisão. Antes de repassar sua licença ao Tuntum, o clube se mudou de São Luís para Bacabal, e em 03 de julho de 2019 alterou seu nome para Clube Atlético Bacabal.

O Esporte Clube Viana foi fundado em 15 de julho de 1995 no município de Viana. Em 2024, o clube fez uma parceria com o Real Codó Esporte Clube, clube de Codó fundado em 28 de maio de 2024. Na parceria, o clube de Codó utilizou o CNPJ e a licença do Viana para a disputa do campeonato estadual da 2ª divisão, na qual acabou obtendo o acesso e o título. Para 2025 a parceria acabou desfeita, e o Viana voltou a utilizar seu nome de fundação e a disputa da elite estadual.